创建共和国
哥伦比亚共和国
1819年，2月15日，玻利瓦尔建立安戈斯图拉议会，并发表了著名的演说。他被选为委内瑞拉总统，立即发动解放新格拉纳达的战役。8月7日，博亚卡战役。12月17日，玻利瓦尔创建哥伦比亚共和国， 并把它分为三个省：委内瑞拉、昆迪纳马卡和基多。议会选举他为哥伦比亚总统。
1820年，l月11日，在阿普雷州的圣胡安·德帕亚拉市。3月5日，在波哥大。4月19日，在圣克里斯托瓦尔庆祝革命十周年。11月27日，在特鲁希略省的圣安娜市会见西班牙殖民军队最高司令巴勃罗·莫里略。前一天，他们签署了停战协定和西班牙承认善后独立战争条约。
1821年，1月5日，在波哥大制定南方战役计划，并将此项任务交给苏克雷。2月14日，玻利瓦尔向拉斐尔·乌达内塔祝贺马拉开波宣告独立，尽管他表示担心西班牙方面会认为他居心叵测，从而损害停战协定。4月17日，玻利瓦尔发表公告宣布撕毁停战协。并开始“圣战”。公告说：‘战争的目的是为了解除敌人的武装，而不是消灭它。”4月28日，敌对行动重新开始6月27日，玻利瓦尔在卡拉博博战胜了拉托雷。尽管这不是最后的一战，但在卡拉博博保证了委内瑞拉获得独立。
1822年，4月7日，蒂博纳战役。5月24日，皮钦查战役6月16日，玻利瓦尔同苏克雷并肩胜利进入基多时，结识了曼努埃拉·萨恩斯。7月11日，玻利瓦尔到达瓜亚基尔，两天之后，宣布将它并入哥伦比亚。7月26日至24日，玻利瓦尔和何塞·德圣马丁将军在瓜亚基尔会面。10月13日，在厄瓜多尔昆卡附近的洛哈城，玻利瓦尔写了《我在钦博拉索的大胆预言》。
1823年，3月1日，秘鲁总统里瓦·阿圭罗要求“解放者”给4000援兵和得到哥伦比亚的物资授助以取得秘鲁独立。玻利瓦尔3月17日派去一支3000人的远征军，紧接着4月12日又派出3000人的援军.5月14日，秘鲁议会宣布法令，呼吁“解放者”结束内战。9月1日，玻利瓦尔到达秘鲁的利马。议会授权他降服叛变倒向西班牙人一边的里瓦·阿圭罗。
1824年，1月1日，玻利瓦尔在秘鲁沿海城市帕蒂维尔卡患重病。1月12日，发布命令将从国库中偷10比索以上的人全部处以极刑。1月1日，玻利瓦尔给他的老师西蒙·罗德里格斯写了一封非常动人的信，他说，“您培养了我一颗为了自由、正义、为了伟大的事业和为了世上最美好东西的心灵。”2月10日，为了挽救摇摇欲坠的共和国，秘鲁议会任命他为独裁者。8月6日，胡宁战役大捷。12月5日，玻利瓦尔解放利马。12月7日，召集巴拿马议会。12月9日，苏克雷取得阿亚库乔战役的胜利。整个西班牙美洲彻底解放。
玻利维亚共和国
1825年，英国承认美洲新国家的独立。2月12日，为表示感激玻利瓦尔，秘鲁议会下令授予玻利瓦尔种种荣誉：一枚勋章，一座骑士雕象，1百万比索给玻利瓦尔本人，100万比索给他的军队。玻利瓦尔谢绝了议会给他的钱，接受了给他的士兵的钱。2月18日，秘鲁议会拒绝玻利瓦尔辞去拥有无限权力的总统职位。8月6日，上秘鲁国民议会在丘基萨卡召开，决定成立玻利维亚共和国。10月26日，玻利瓦尔登上玻利维亚波托西山顶峰。12月25日，在丘基萨卡下令在最需要的地方栽种100万棵树木。1826年，5月25日，玻利瓦尔从利马通知苏克雷秘鲁已承认玻利维亚共和国。同时把玻利维亚宪法草案寄给他。6月22日，设立巴拿马议会。12月16日，玻利瓦尔到马拉开波，在那里答应委内瑞拉人召开大国民议会。12月31日，抵达卡贝略港寻找派斯。
1827年，1月1日，下令大赦科西亚塔事件的负责人。批准派斯为委内瑞拉最高首领。1月2日，在卡贝略港写信给派斯，他说：“我不能分裂共和国，但是我愿意委内瑞拉一切美好。如果委内瑞拉自愿分裂出去，那要提交代表大会解决。”1月4日，在巴伦西亚附近的纳瓜会见派斯，并给予他支持。此前他曾对他说过，“他有权以正义反对非正义，以不服从波哥大议会来反对滥用武力。”为此，玻利瓦尔得罪了桑坦德，桑坦德开始对“解放者”不满。1月12日，玻利瓦尔和掀斯抵达加拉加斯，受到群众热烈欢迎。2月5日，玻利瓦尔从加拉加斯致函波哥大议会，再次提出辞去总统职务。他提出种种令人感动的理由，最后说：“我怀着这样的心情，一次，一千次，成千上万次地辞去共和国总统……”3月16日，彻底和桑坦德决裂“您不要再给我写信，我既不愿意给您回信，也不愿称您为朋友”6月6日，哥伦比亚议会拒绝玻利瓦尔的辞呈，并要求他去波哥大宣誓就职7月5日.离开加拉加斯赴波哥大。此后他再没有回到他的故乡城市。9月10日，抵达波哥大，面对政治上的凶恶的反对派，宣誓就职哥伦比亚共和国总统。9月11日，写信给托马斯·德埃雷斯，他说，“昨天我进入这个首都，并已就任总统。这样作是必要的，为的是克服无数的困难来避免许多灾难。”
1828年，4月10日，在举行奥卡尼亚议会的同时到达布卡拉曼加。在议会上，明确建立了玻利瓦尔党和桑坦德党。玻利瓦尔向议会抗议“赦免帕迪利亚将军的行动，因为他在卡塔赫纳犯了谋杀罪。”6月9日，离开布卡拉曼加计划去委内瑞拉，打算住在托罗侯爵的阿瑙科乡间别墅。6月11日，奥卡尼亚议会宣布解散。6月24日，改变计划，回到波哥大，受到欢迎。7月15日，在巴伦西亚发表的公告中，派斯称玻利瓦尔为“十九世纪的奇才”，“十八年来他一直为你们的幸福做出牺牲。他做了力所能及的一切他无数次地放弃最高指挥权，但是，在目前共和国的具体状况下，他不得不行使这一权力。”8月27日，鉴于奥卡尼亚议会的挑战，颁布独裁组织法。玻利瓦尔废除副总统，桑坦德被排斥在政府之外。“解放者”委派桑坦德任哥伦比亚驻美国大使，桑坦德接受了这一职务，但推迟行期不赴任。撤销桑坦德的职务有可能引起了谋害玻利瓦尔事件的发生。9月21日，派斯承认玻利瓦尔最高领袖，他在大主教拉蒙，伊格纳西奥·门德斯和聚梁在加拉加斯大广场上的人群面前宣誓：“……我宣誓服从，维护和执行玻利瓦尔发布的一切法令，因为我把它们视为共和国的法律。苍天是我宣誓的见证人，他将嘉奖我实现诺言的忠诚。”9月25日，有人企图在波哥大暗杀玻利瓦尔。曼努埃里塔·萨恩斯救了他。桑坦德涉嫌。乌达内塔作为审讯法官判处他死刑，玻利瓦尔改死刑为流放。
1829年，1月1日，玻利瓦尔到达布里菲加森。他之所以去厄瓜多尔是因为秘餐军事占领了瓜亚基尔，两国发生冲突。2月27日，苏克笛在德塔尔基的波特特战役中打败拉马尔指挥的秘餐入侵者。7月21日，哥伦比亚复克瓜亚基尔。人民欢迎“解放者”凯旋归来。9月13日，玻利瓦尔写信给奥利里，说：“众所周知.新格拉纳达和委内瑞拉的联合只是由我的权威来维系，而当上帝和人民愿意的时候，这种权威现在和今后都会丧失……”。9月13日，致函派斯，他写道：“我已命令向所有公民和社会团体发出通告，要求他们郑重其事地发表意见。现在您可以正式地敦促他们，让民众说出心里话。如今已到了委内瑞拉提出自己主张的时候了，它除了全局的利益外，什么也不要考虑。如果采取根本措施让你们说出真实打算的话，改革将会圆满完成，公众的愿望也会得到满足……”10月20日，回到基多。10月29日，赴波哥大。12月5日，玻利瓦尔从波帕扬给胡安·何塞·弗洛雷斯写信，他说：“苏克雷将军可能是我的继承人，大概我们所有人都会支持他，从我这方面说，我将全心全意这样做。”12月15日，他向派斯表示不再接受共和国总统职务，如果议会推选派斯当哥伦比亚总统的话，他以自己的名誉发誓将十分乐意为他效劳。12月18日，他断然拒绝在哥伦比亚实行君主政体的草案。
辞去总统职务
1830年，1月15日，重新去波哥大。1月20日，哥伦比亚议会成立，玻利瓦尔致函提出辞去总统职务1月27日，要求议会准许他去委内瑞拉。哥伦比亚议会拒绝了他的请求。3月1日，玻利瓦尔将权力移交国务委员会主席多明戈·凯塞多，而后退居富查。4月27日，在致特别议会的信中重申他不再继续担任总统的决心。5月4日，华金·莫斯克拉当选为哥伦比亚总统。5月8日，玻利瓦尔离开波哥大去他的最后归宿之地卡塔赫纳。6月4日，苏克雷在伯鲁埃科斯遇刺身亡。玻利瓦尔在卡塔赫纳附近波帕山下获悉这一消息，深感震惊。9月5日，乌达内塔在显然缺乏公众威信的情况下主持哥伦比亚政府工作。在新格拉纳达的波哥大、卡塔赫纳和其他城市发生游行示威和暴动要求“解放者”重新执政.与此同时，乌达内塔等待他归来。
拒绝重新执政
1830年9月18日，当获悉安排乌达内塔领导政府工作后，玻利瓦尔表示甘愿做一个公民和战士来保卫共和国的完整，并宣布将率2000人去波哥大支持现存政府。他部分地拒绝了人们要他重新执政的要求，理由是，如他重新上台会有篡权之嫌，但同时他也明确表示，在以后的选举中，“合法的阴影将会笼罩着他，或者产生一位新的总统。”最后，他要求同胞们团结在乌达内塔政府周围。10月2日，在图尔瓦科。10月15目，在索莱达。11月8日，在巴兰基利亚。
阖然长逝
1830年12月1日，拖着病体疲惫不堪地抵达圣玛尔塔。12月6日，在圣佩德罗·亚历杭德里诺乡间别墅，这是一个名叫华金·德米耶尔的西班牙人的产业。12月l0日，口授遗嘱和最后一次公告，在医生的一再坚持下，他作了忏悔和接受了圣礼。玻利瓦尔说：“这是怎么回事?……难道我的身体已经到让你们给我谈遗嘱和作忏悔的地步了吗?……我怎样才能从这个迷宫中走出去啊!”12月17日，在圣佩德罗·亚历杭德里诺乡间别墅阖然长逝。
