二次北伐
1928年初，蒋中正趁广州事变及“桂系排汪”造成的影响，得以复出。1月9日，蒋中正正式在南京复职国民革命军总司令，新桂系军队被迫撤出南京、江南要害富庶之地，发展受到挫折。蒋中正与宋美龄结婚时，李宗仁是国民 ... 全体中央委员中唯一一个未送结婚贺礼之人。
1928年4月，李宗仁被南京国民 ... 任命为国民革命军第四集团军总司令兼武汉政治分会主席。第四集团军由新桂系嫡系部队和改编的原唐生智两湖部队所组成，共辖十六个军又六个独立师。指挥部队北上，开始“二次北伐”，讨伐奉系军阀张作霖，第四集团军进至北平、天津、山海关。桂系控制的地区从两广、两湖至平津，总兵力逹二十余万人。
当时，对于是否接受张作霖之子张学良之投诚，国民革命军内部分歧极大。不同于阎锡山、冯玉祥主张国民革命军一定要进驻东北，全部遣散奉系军队的主张；李宗仁则主张接受张学良投诚，并可继续管理东北事务。最终蒋中正采纳了李宗仁的意见。
蒋桂战争
1928年北伐成功，国民 ... 召开国民革命军善后编遣会议，李宗仁主张“赏罚奖惩公平”，即：裁无军功之军队，留有功之军队；裁军功小者，留军功大者。会议最后因各方分歧太大而没有实际结果。李宗仁后就任军事参议院院长一职。
同年初，李宗仁出于控制湖南之目的，软禁主政湖南之程潜，任命何键、鲁涤平主持湖南政务。但鲁、何二人不和。1929年2月，鲁涤平暗地投向蒋介石，蒋介石并绕过武汉政治分会接济鲁涤平部大批军械弹药，何键查扣后当即上报武汉政治分会，新桂系将领夏威、胡宗铎、叶琪等人大惧，在未得到李宗仁同意，亦未与三号人物白崇禧商讨之前提下，于2月21日仓促以武汉政治分会名义发报中央，宣布免去鲁涤平本兼各职。同日，夏威、叶琪二人率军进入长沙，将鲁涤平部缴械，鲁逃离长沙。
3月21日，国民 ... 发表声明，免去李宗仁、白崇禧、李济深本兼各职，武力讨伐新桂系。冯玉祥，阎锡山两派观望形势，态度暗昧。李宗仁为表和平态度，长驻南京、上海，此举在军事上使新桂系从一开始就陷于不利境地。最后新桂系被击败。李宗仁、黄绍竑、白崇禧等逃往法属安南（今越南）、香港。
全面内战时期
蒋介石随后任命俞作柏、李明瑞、杨腾辉、郑介民主政广西。俞、李二人因政治面貌左倾亲共，在广西引入 ... 、陈豪人等 ... 人进行活动，宣传赤色革命。郑介民将此情形密报蒋介石，南京国民 ... 遂于1929年10月将俞、李二人免职。而郑介民则因离间、监视桂系的特殊功勋，其后成为军统局首脑人物。杨腾辉则与俞、李分道扬镳，联同大批原桂系军官对李宗仁表示重新效忠，李宗仁、白崇禧遂在此一片混乱的局势下返回广西，重新掌握了俞、李、杨三人之部队及湖北陆续逃回的桂军官兵。1929年11月，新桂系联络参加“湖北讨桂之役”的张发奎、薛岳共同反蒋，第二次蒋桂战争爆发，激战至1930年2月，白崇禧在桂北击破中央军朱绍良、谭道源等部，黄绍竑、张发奎、薛岳等却在桂东被粤军陈济棠、陈铭枢、蒋光鼐、蔡廷锴等部击败，双方一胜一负，战况持平，形成对峙局面。
1930年5月，新桂系北上参加中原大战，李宗仁对此次北伐信心十足，专门委托香港印钞厂印制大批我国国民银行钞票，准备占领武汉后公开发行。初期大捷，自桂林北上后势如破竹，6月初即攻占长沙、岳阳，迫近武汉；但终因黄绍竑态度犹疑，行军迟缓，致使新桂系部队被各个击破。新桂系、冯玉祥、阎锡山三大派别在中原大战中都被蒋介石击败。蒋介石自此战后，彻底削弱了 ... 内部其他军事派别，获得了国民 ... 之中央名义，其嫡系部队又被称为“中央军”。
中原大战的失败并没有动摇新桂系在广西的统治权。但是，新桂系二号人物黄绍竑脱离了新桂系，在允诺不出卖新桂系团体利益以及取得李宗仁、白崇禧的谅解之下，投向蒋介石。新桂系“李黄白”三人体系瓦解。黄绍竑接受了蒋介石的任职，但并没有积极为蒋介石工作。
整顿广西
1931年9月发生九一八事变，蒋中正于12月15日通电辞职下野。1932年1月，上海发生淞沪一。二八抗战， ... 内各派系因而谋求妥协、一致团结抗日。1932年4月，李宗仁出任广西绥靖主任，白崇禧任副主任，和省主席黄旭初形成“后李白黄”体制。
抗战期间
李宗仁1938年在台儿庄
1936年4月，李宗仁发表了“我的主张-焦土抗战”一文，从政治、经济、军事、外交四个方面阐述中日全面战争一旦爆发，最后的胜利者必是我国，号召全国军民宁为玉碎，不为瓦全，化全国为焦土，用大刀阔斧来答复侵略者。
1937年7月，抗日战争爆发。李宗仁任第五战区司令长官。1938年1月至6月，李宗仁指挥国民革命军抗击日军，在台儿庄会战中李宗仁亲临前线督战指挥，获得国军抗战中的首次大胜。在台儿庄会战中，李宗仁成功化解了张自忠与庞炳勋之间的宿怨。同年先后指挥徐州会战、武汉会战。徐州大突围中李宗仁简介，李宗仁成功指挥60万大军突围李宗仁简介，国军未出现淞沪会战、南京保卫战撤退时的混乱景象。
1939年后，指挥随枣会战、枣宜会战、豫南会战抗击日军。李宗仁在任第五战区司令长官期间，要求所部官兵“宁肯吃树皮，决不可扰民”；并成功警诫张自忠全军禁烟禁赌。
1939年9月，李宗仁在与史迪威、朱可夫分别晤谈期间，曾准确预测法国之马其诺防线不足恃，英法联军必败；而英法一旦失败，则苏德互不侵犯条约立成废纸，希特勒必然东进，斯大林此时自以为得计，实大祸不远矣。
1944年6月，李宗仁分别致备忘录与我国战区参谋长魏德迈将军、美国驻华大使赫尔利、英国驻华军事代表卫阿特将军，希望“盟军不要急于开辟欧洲第二战场，在此期间应全力消灭日本，待德、苏皆奄奄一息，再行东西对进，德苏两雄自将俯首就擒，战后之世界自由和平指日可待”，李宗仁尤其反对“美英企望苏军加入我国战场，对日本关东军作战”。
1944年底，蒋介石为防止以李宗仁为首的桂系力量壮大，将李宗仁从第五战区司令长官的位置调升为军事委员会委员长驻汉中行营主任，名义上是指挥第一、五、十3个战区，实则是虚设机构，明升暗降，以削去兵权。
国共内战时期
1945年抗战胜利后，围绕如何处理 ... 问题，李宗仁与蒋中正之间产生诸多分歧。被任命为国民 ... 主席北平行辕主任，名义上统帅冀、鲁、察、绥、热、平、津、青五省三市。实则并无调兵遣将、驭控下属之实权。在此期间，李宗仁韬光养晦，结交胡适、齐白石、甘介侯、司徒雷登等文化名流。
1947年底，李宗仁拒绝在无实际权力（即“生杀予夺”）下总责华北、东北事务，且其“东北华北剿匪方略”亦被蒋中正否定。在此情形下，李宗仁三度拒绝指挥东北战事，坚持参选“中华民国”副总统。1948年3月，国民大会召开，选举第一任行宪总统和副总统。李宗仁在蒋介石的反对和压力之下，最终在4月29日，以1438票对1295票，击败蒋介石属意的孙科当选副总统。
蒋介石和李宗仁摄于就职礼后。据李宗仁回忆，蒋介石故意不让他知道要穿着中式礼服，结果他穿军装，看起来好像是蒋的副官。
1948年年5月底，蒋介石调任白崇禧为华中剿总司令长官。李宗仁强烈反对蒋总统设立华中剿总这一机构，认为黄河以南、长江以北地区应有华东剿总统一指挥；若硬要一分为二，也应有白崇禧出任华东剿总。李在与亲信将领闲谈时，曾说“徐州是南京的北大门，理应派一只虎去，至少也要派一只狼，结果却派了一头猪”，此言在国共双方军中流传甚广。
1948年年底，国民 ... 军队在 ... 发动之三大战役中大败，国、共军事力量逆转为150万：400万。经济上，上海爆发金圆券风暴。外交上，杜鲁门上台后表示对蒋介石失去信心。1949年1月1日，蒋中正发布元旦文告宣告引退，由李宗仁“代行”总统职权。白崇禧立即致电李宗仁逼蒋中正出国。李、蒋双方拉锯多次后，蒋中正委托居正、阎锡山、张治中、吴忠信转告李宗仁“保证5年内不干预政治”，且“宁愿一死，亦决不出国！”。李最终也因严峻的时局所迫，态度软化，于1月21日正式接任“中华民国”代总统。
李宗仁希望透过和谈，再依仗长江天险，可以阻止人民 ... 的进攻；另一方面则希望争取到美国的支持，以挽救国民 ... 的政权。可是李宗仁上台之后，国民 ... 军政机构处处仍受到蒋介石暗中操控；美国亦没有提供先前承诺的援助。行政院长孙科在蒋介石的支持下，无视李宗仁的命令，将行政院内阁搬至广州。李宗仁力压，最终孙科于3月辞职，行政院长一职改由何应钦担任，然何应钦在李代总统与“平民”蒋介石之间无法自处，为求“明哲保身”计终于辞职，后由阎锡山接任。
而李宗仁试图稳定货币之努力，因蒋介石擅自命令蒋经国、汤恩伯、桂永清将中央银行所有黄金、白银、美钞外汇转运台湾省亦告失败，李虽多次飞台，令台湾省省主席陈诚将金银运回大陆，终无果。
1949年4月，李宗仁派以张治中为首的六人谈判团抵达北平，与 ... 展开谈判。和谈最终宣告破裂。4月20日， ... 渡过长江。4月23日， ... 攻占南京，国民 ... 迁往广州。李宗仁先飞往桂林，5月8日飞往广州，发表讲话，表示将“决心戡乱到底”。
之后半年， ... 席卷全国。10月1日， ... 在北京的天安门城楼宣告中华人民共和国中央人民 ... 成立。10月13日， ... 兵临广州，李宗仁只得飞往重庆。11月16日，李宗仁胃病复发，出现十二指肠出血，加之蒋介石复出已暗流汹涌，遂决定以治病为由转往香港，并将中枢军政交由阎锡山主持，12月5日，与夫人郭德洁，两名儿子及随从从香港飞往美国纽约。
晚年岁月
1949年11月20日以就医为名，从南宁乘专机飞往香港。12月飞往美国。此后，在美国度过了十六年流亡生涯。 1950年3月蒋介石在台湾省恢复总统职务。 1954年3月，蒋介石正式罢免李宗仁副总统职务。1956年4月到1965年6月十年间，先后五次派程思远到北京，会见周恩来总理，为回归我国大陆作准备。1965年7月冲破重重险阻，偕妻回到我国大陆。 7月20日从美国回到北京，在机场发表声明，决定为完成国家最后统一做出贡献。回国后，受到 ... 、 ... 、周恩来和朱德等我国领导人接见。1969年1月30日因肺炎在北京逝世。（关于他的死有争议，在他死之前涉入梅花党，他被迫交出所谓“名单”，后他的秘书著书称他是被“革命群众”毒死。） 李宗仁故居坐落在距桂林市约30公里的临桂县两江镇浪头村。
