高祖初年，整顿吏治，李崇为大使巡察冀州，不久，任梁州刺史。齐国犯边，诏李崇为将军、荆州刺史，镇上洛。李崇不主张用兵，奏曰：“边人失和，本怨刺史，须以宣诏而已，不劳发兵自防。”高祖从之。李崇整饬边戍，宣诏绥慰。将所掠齐国人悉数送还。齐国人感德，仿还荆州人200余口。两境交和，无复烽火之警。李崇治荆州四年，甚有政绩。
延兴五年(475年)，李崇任兖州刺史。兖地多劫盗，李崇创鼓楼之制。令各村建一楼，楼悬一鼓。盗发之处，双槌击鼓，四面诸村始闻者擂鼓一通，次闻者以二为节，后闻者以三为节，各击数千槌。俄倾之间声布百里，其中险要皆有伏人，盗窃始发便可擒拿。诸州置楼悬鼓自此始。李崇受封为侯，加封安东将军。
高祖孝文帝南征，以李崇为副骠骑大将军。降人郭陆聚众起事，人多响应，搔扰南北。李崇遣卜冀州诈称犯罪投郭陆，被纳为谋主。数月后，卜借机斩郭，其众溃散。李崇升任河南尹。
太和初年，高祖南讨汉阳，李崇任梁州刺史。巴氐部杨灵珍遣弟婆罗与子杨双率步骑万余袭破武兴，与齐国相结。高祖授李崇为使持节、都督陇右诸军事，率众数万征讨。李崇槎山分进，出其不意，歼敌大半，遂进居赤土。灵珍又遣堂弟杨建率兵5000屯龙门，自率精兵1万据鹫硖。在龙门以北数十里中伐树塞路，于鹫硖之口积大木，聚大石，以拒官军。李崇命统军慕容拒领兵5000，从他路夜袭龙门，自率军攻灵珍，灵珍连战败走，俘其妻子，继而攻克武兴。齐国郑猷、王思考率兵救援灵珍，李崇大破之，斩婆罗首，杀千余人，俘获郑猷等，灵珍败逃汉中。高祖在南阳览表大悦，曰：“使朕无西顾之忧者，李崇之功也”。授李崇都督梁秦二州诸军事。未几，灵珍又袭据白水，李崇又率军破之，灵珍远遁。
镇守一方
世宗初，征为右卫将军，兼七兵尚书，旋加抚军将军、正尚书，转左卫将军、相州大中正。景明三年(502年)四月，鲁阳柳北喜、鲁北燕等聚众数万，围逼湖阳。李崇为使持节、都督征讨诸军事，累战破之，斩北燕等，迁万余户于幽、并二州，世宗封李崇为魏昌县开国伯。
景明四年(503年)十二月，东荆州樊安举兵于龙山，僭称大号，南朝梁国遣兵策应。北魏诸将进攻失利，乃以李崇为使持节、镇南将军、都督诸军讨之。李崇分遣诸将攻敌营垒，连战皆捷，生擒樊安。继击西荆，大获全胜。世宗加封李崇兼侍中、东道大使、征南将军、扬州刺史。延昌初，加封侍中、车骑将军、都督江西诸军事。李崇深沉有将略，宽厚善御众，镇守杨州10年，常养精兵数千，所向摧破，屡平边患，号曰“卧虎”。南朝梁武帝久谋除李崇，屡设反间计，而世宗却更信任李崇。梁武帝曾以高官厚禄诱李崇叛投，李崇不为所动。
延昌元年(512年)，大雨13日，水淹杨州，房屋皆没。李崇不畏险恶，与兵泊于州城。下官劝李崇弃城北上。李崇曰：“吾受国重恩，忝守藩岳，淮南万里，系于吾身。一旦动脚，百姓瓦解，杨州之地，恐非国物……吾岂爱一躯，取愧千载。但怜兹士庶，无辜同死。可桴筏随高，人规自脱。吾必守死此城”。时州人裴绚乘大水作乱，李崇率众歼灭之。事后，李崇以洪水为灾请罪解任。世宗未准，且下诏慰劝。
肃宗初，授李崇为中书监、骠骑大将军、仪同三司。又授右光禄大夫，出为使持节，都督定、幽、燕、瀛四州诸军事，定州刺史。后征拜尚书左仆射，迁尚书令，加侍中。李崇在官和厚，明于决断，受纳辞讼，必理在可推始为下笔。然性好财货，贩肆聚敛，家资巨万，营求不息。其长子世哲为相州刺史，亦无清白状。邺洛市廛，收擅其利，为时论所鄙。
晚年经历
熙平元年(516年)，南朝梁武帝遣游击将军赵祖悦袭据西硖石，又遣昌义之、王神念二将溯淮而上取寿春，田道龙攻边城，路长平攻五门，胡兴茂攻开霍，杨州诸戍皆遭攻击。李崇分遣诸将与之相持，密装船舰200余艘，教以水战，以待大军。梁国霍州司马率众攻建安，李崇遣统军李神轨率军迎战，又命边城戍主邵申贤堵其要路，破敌于濡水，俘斩3000余人。灵太后玺书劳勉。许昌县令兼绥麻戍主陈平玉投梁，引军北进。李崇上表10余请援。世宗遣镇南将军崔亮救硖石，镇东将军萧宝夤于梁境决淮东注，以尚书李平兼右仆射持节节度。李崇沿淮进击，策应李平、崔亮合攻硖石，大败祖悦。战后，朝廷嘉奖李崇，晋号骠骑将军、仪同三司。萧宝夤决淮堰未破，水势日增。李崇乃于硖石戍间编舟为桥，立船数十，各高三丈，十步置一篱，至两岸。又于楼之北连复大船，东西竟水，防敌火栰。于八公山东南筑起一城。以备大水，州人号曰“魏昌城”。
正光四年(523年)，柔然部阿那环率众攻魏，肃宗诏李崇都督北讨诸军事讨敌。李崇辞于显阳殿，戎服武饰，志气奋扬，虽时年六十九，而干力如少，朝臣莫不称善。李崇遂长驱塞北3000里。后上表请改六镇为州，罢削旧贯，肃宗未准。
六镇破六韩拔陵举兵，征北将军元彧大败于五原，安北将军李叔仁败于白道。前锋失利，二将殒命。肃宗诏文武于显阳殿议事。众曰：“李崇德位隆重，社稷之臣，陛下此遣，实合众望。”帝诏李崇以本官加使持节、开府、北讨大都督，又诏李崇子李神轨，假平北将军，随父北讨。军至五原，将军崔暹大败于白道之北，敌遂合力攻李崇。李崇力战，累破敌众，挫敌攻势，相持至冬，引还平城。广阳王元渊上表奏李崇军长史诈增功级、盗没军资，李崇坐免官爵。
不久，徐州刺史元法僧以彭城投南朝。帝以安乐王元鉴为徐州刺史讨之，大败，单骑奔归。乃诏复李崇官爵，为徐州大都督、节度诸军事。时李崇病重未就任，改授相州刺史。孝昌五年(525年)卒于官，时年七十岁。赠侍中、骠骑大将军、司徒公、雍州刺史，谥曰武康。后重赠太尉公，增邑一千户。
