聚丙烯酰胺凝胶DNA回收试剂盒
以下是索莱宝的聚丙烯酰胺凝胶DNA回收试剂盒介绍(仅供参考)
本试剂盒采用可以高效、专一结合DNA的硅基质材料和独特的缓冲液系统,从聚丙烯酰胺凝胶上回收DNA片段,同时除去蛋白质、其它有机化合物、无机盐离子及寡核苷酸引物等杂质。使用本试剂盒回收的DNA可适用于后续各种常规操作,包括酶切、PCR、测序、文库筛选、连接和转化等实验。
操作步骤:
第一次使用前请先在15ml漂洗液中加入60ml无水乙醇,所有离心步骤均可使用台式离心机在室温下离心。
1.将单一的目的DNA条带从聚丙烯酰胺凝胶中切下(尽量切除多余部分),放入1.5ml离心管中,称取重量,用研磨杵将胶尽量挤压碎。加入2倍体积的提取液吹打混匀(每100mg胶加入200ul提取液),75℃水浴30分钟。
2.用1ml的去尖吸头吸取混合物至过滤柱中(将胶一起吸入,溶液过多时可分次加入),13,000rpm离心1分钟。将收集管中的滤出液转入新离心管中。
3. 取6倍体积结合液加入原离心管中(每100mg胶加入600ul),清洗管壁后加入过滤柱中(溶液过多时可分次加入),颠倒过滤柱或轻轻吹打几次混匀,13,000rpm离心1分钟。将所有收集的滤出液混合。
4.将总滤出液混匀后加入吸附柱中(溶液过多时可分次加入),13,000rpm离心30-60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放入收集管中。
5.向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),13,000rpm离心30-60秒,倒掉废液,将吸附柱重新放入收集管中。
6.向吸附柱中加入600ul漂洗液,13,000rpm离心30-60秒,倒掉废液。
7.将离心吸附柱放回收集管中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液。将吸附柱开盖置于室温1-2分钟,彻底晾干,以防止残留的漂洗液影响下一步的实验。
8.将吸附柱放到一个干净离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加适量65–70℃预热的洗脱缓冲液20-30ul,室温放置2分钟。13,000rpm离心2分钟收集DNA溶液。注意:①为了增加回收效率,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,13,000rpm再次离心1分钟。②洗脱缓冲液体积不应少于20ul,体积过小影响回收效率。③洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5之间。
9.DNA回收产物直接后续实验或者-20℃保存。
Takara胶回收试剂盒 说明书,具体操作步骤
1. 琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段,任何类型或等级的琼脂糖都可以使用.我们强烈的建议您使用新鲜的TAE Buffer作为电泳缓冲液.不要重复使用电泳缓冲液,因为会因其PH的升高而减少产量.新鲜的TBE也可以用,但只能得到较低的产量.
2. 当所需DNA片段完全分离时,转移凝胶至紫外灯上,尽可能快地把所需的DNA片段切下来.
注:切胶时尽量把多余的凝胶切去,DNA曝露在紫外灯下不能超过30秒.
3. 将带有目的片段的凝胶块转移至1.5ml离心管(离心管已经称重了)中,称重得出凝胶块的重量.近似地确定其体积.假设其密度为1g/ml(几乎所有DNA凝胶的密度都可以近似为1g/ml),于是凝胶块的体积便可通过如下方法得到:凝胶薄片的重量为0.2g, 则其体积为
0.2 ml.加入等体积的Binding Buffer(XP2),于55-65℃水浴中温浴7min或至凝胶完全融化,每2-3 min振荡或涡旋混合物.
重要提醒:在凝胶完全溶解之后,注意凝胶-Binding buffer混和物的pH值.如果其pH值大于8的话,DNA的产量将大大减少.观察混和物的颜色,如果是橙色或红色,则要加入5 ul 浓度为5 M,pH为5.2的醋酸钠,以调低其pH值.经过这一调节,该混合物的颜色将恢复为正常的浅黄色.
4. 取一个干净的HiBind DNA Mini柱子装在一个干净的2ml收集管内(已备好).
5. 将第三步获得的DNA/熔胶液全部转移至柱子中.室温下10,000 x g离心1分钟.弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内.
6. 如果DNA/凝胶熔液的体积超过700ul,一次只能转移700ul至柱子中,余下的可继续重复第5步至所有的溶液都经过柱子.每一个Hibind DNA回收纯化柱都有一个极限为25gDNA的吸附能力.如果预期产量较大,则把样品分别加到合适数目的柱子中.
7. 弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内.移300ul Binding Buffer(XP2)至柱子中,室温下, 10,000 x g下离心1min.
8. 弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内.移700ul SPW Wash buffer(已用无水乙醇稀释的)至柱子中.室温下10,000xg离心1min.
注意:浓缩的SPW Wash Buffer 在使用之前必须按标签的提示用乙醇稀释.如果DNA 洗涤缓冲液在使用之前是置于冰箱中的,须将其拿出置于室温下.
9. 重复用700ul SPW Wash buffer洗涤柱子.室温下10,000xg离心1min.
10. 弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内.室温下,13,000 x g离心2 min以甩干柱子基质残余的液体.
11. 把柱子装在一个干净的1.5ml离心管上,加入15~30ul(具体取决于预期的终产物浓度)的Elution Buffer(或TE缓冲液)到柱基质上,室温放置1min, 13,000xg离心1min以洗脱DNA.
第一次洗脱可以洗出70-80%的结合DNA. 如果再洗脱一次的话,可以把残余的DNA洗脱出来,不过那样的浓度就会较低.
抗生素抗性基因检测实验操作步骤
本文以客户的案例为背景,介绍了实时荧光定量PCR法检测抗生素抗性基因的所需的试剂耗材以及详细的实验操作步骤。
实验摘要
以目的DNA为模板,PCR扩增获得目的片段,进行TA克隆。提取质粒,单酶切线性化,进行梯度稀释获得一系列不同浓度的标准品。通过 实时荧光定量PCR ,采用SYBR GREEN染料法,对样品进行绝对定量。
1.试剂与耗材
试剂与耗材
样品:45例土壤样品。胶回收试剂盒,美国Axygen公司,AP-GX-50。
2×Taq PCR MasterMix,南京钟鼎生物技术有限公司,PC16-1。SoilPure超纯土壤基因组DNA快速提取试剂盒,北京艾德莱,DN27。
SYBR Premix Ex Taq II(Tli RNaseH Plus),Bµlk,宝生物工程(大连)有限公司,RR820L。Hind III,宝生物工程(大连)有限公司,1060A。
EcoR I,宝生物工程(大连)有限公司,1040A。pMDTM19-T Vector Cloning Kit,宝生物工程(大连)有限公司,6013。
Zero Background pTOPO-TA Cloning Kit,北京艾德莱生物有限公司,CV1401。DL2000 DNA Plus Marker(100、250、500、750、1000、1500、2000 bp),南京诺唯赞生物技术有限公司,MD101。
1Kb DNA Ladder Marker(1、2、3、4、5、6、7、8、9、10 kb),南京诺唯赞生物技术有限公司,MD105-01。GelStain,北京全式金生物技术有限公司,GS101-01。
Agarose,西班牙Biowest公司,91622。离心管,美国Axygen公司,311-01-051。
枪头,美国Axygen公司。其它试剂均为国产分析纯。
2.主要实验仪器
试剂与耗材
荧光定量PCR仪,杭州BIOER,Lightcycle K。基因扩增梯度PCR仪,杭州博日,TC-96/G/H(b)C。
台式高速冷冻离心机,美国BECKMAN公司,Allegra 21R。电子天平,美国AHOMS公司,AR5120。
恒温水浴锅,美国Amersham Pharmacia公司,MultiTemp III。紫外透射仪,美国Amersham Pharmacia公司,Hofer MV-25。
雪花状制冰机,日本SANYO公司,SIM-F140AY65。移液器,德国Eppendorf公司。
单人单面(垂直送风)洁净工作台,苏州苏洁净化设备有限公司,SJ-CJ-1FD。
3.抗性基因检测实验步骤及结果
3.1.DNA提取
提取步骤参见SoilPure超纯土壤基因组DNA快速提取试剂盒说明书。
3.2.DNA扩增
PCR反应体系如下:
PCR反应体系如下:
3.3.TA克隆
pMDTM19-T Vector Cloning Kit,宝生物工程(大连)有限公司,6013。
Zero Background pTOPO-TA Cloning Kit,北京艾德莱生物有限公司,CV1401。
(1)将上述PCR产物切胶回收后,在PCR管中配制下列溶液:
(2)室温(20℃-30℃)连接5 min。
(3)取100 µL感受态细胞,置于室温解冻,完全解冻后轻弹几次将细胞均匀悬浮。
(4)加入连接产物,轻轻混匀,室温放置5min。
(5) 向离心管中加入500 µL不含抗生素的LB培养基,混匀。37℃,200 r/min,30 min。
(6)吸取复苏后细菌,均匀涂在含Amp的琼脂培养基上。37℃,倒置待平板吸收全部菌液,过夜培养。
(7)挑取阳性单菌落,PCR检测,并送样测序。
3.4.标准曲线的制作
(1)将阳性菌株,接种到含氨苄抗性的LB培养基中,37℃ 200 r/min,摇菌过夜。
(2)提取质粒,通过单酶切后,回收酶切产物。
(3)测浓度,计算拷贝数,制成标准品。
3.5.荧光定量PCR
反应体系的配制(总体积20 μL):
荧光定量PCR扩增条件的设置:
扩增曲线:94℃ 30 s;94℃ 10 s,60℃ 12 s,72℃ 30 s循环45次,72℃单点检测信号。
溶解曲线:95℃ 0 s,65℃ 15 s,95℃ 0 s,连续检测信号。
3.6.实验结果
您与SCI之间只缺一个: 抗性基因检测服务
钟鼎生物官网
PCR扩增目的基因大小为2500bp,但琼脂糖凝胶电泳检测发现没有扩增出目的基因?
麻烦提供更多信息,按照你目前的情况分析有以下几个原因:1、原因分析:1)引物特异性不好,不能有效扩增目的片段。2)PCR程序设置有问题,95℃ 10min,中间加上循环程序就可以了,根据扩增酶的特性进行设计 95℃ 45s 60-62℃ 30-45s 72℃ 90s左右(延伸时间根据扩增酶效率微调) 72℃ 5min3)正常情况下,模板应该是没有问题,不过也不能排除这个因素;2、建议:1)正式实验时,建议做阳性对照和阴性对照,排除实验中的污染和不确定因素,2)琼脂糖凝胶时,建议同时跑基因组DNA和实验中的阳性样本,加上maker,自然就可以找到是什么问题了。
用小剂量质粒提取试剂盒提取质粒前要做什么工作?
各公司的质粒提取试剂盒大同小异,你这个说明书可能是宝生物的试剂盒。
用试剂盒提,准备工作都比较简单:
1,摇菌;
2,准备ddH2O,无菌枪头和离心管;
3,检查溶液1是否加了Rnase,以及wash buffer是否加了无水乙醇;
3,现在天气冷,检查buffer是否有沉淀,有sds的buffer可能有会有析出,提前开水浴锅,温浴,此外,最后一步加TE或水洗脱质粒时,为提高收获量,在离心前,将柱子在50℃水浴2min更好。
若有疑问,欢迎继续讨论,纯属手打,欢迎采纳,祝实验顺利!