结肠镜有两种：一种金属硬管的；一种就是纤维结肠镜。金属硬管的因为痛苦大，已被废弃；绝大部分医院都采用纤维结肠镜，只有极少数买不起纤维结肠镜的医院还在使用硬管结肠镜。纤维结肠镜检查于20世纪70年代初传人我国，1975年后国内很多医院相继开展此项检查。80年代美国Welch—Allyn公司率先研制出了电子内镜，使内镜技术跨人了电子时代，现已广泛应用于临床。
纤维结肠镜属于光学内窥镜，通常由物镜系统和光学传/转像系统，含有或不含有观察目镜系统构成观察光路的内窥镜。可包含附件。附件是配合内窥镜使用的配件或独立产品。
电子结肠镜属于电子内窥镜，通常由物镜系统、像阵面光电传感器、A/D转换集成模块组成。将所要观察的腔内物体通过微小的物镜系统成像到像阵面光电传感器上，然后将接收到的图像信号送到图像处理系统上，最后在监视器上输出处理后的图像。
结肠镜的清洗消毒常用槽式人工清洗消毒法。必须经过：清洗—消毒—无菌保管3个步骤。充分清洗很重要，不但可以洗除大的污物，同时可使病原菌减少到难以引起感染的程度，并可提高消毒剂的消毒效果。结肠镜附件(如活检钳等金属制品)可采用高压蒸气灭菌。
基本原则：
1.凡穿破黏膜的结肠镜附件，如活检钳、导丝、网篮、高频电刀等必须消毒。
2.结肠镜及附件用后应立即清洗、消毒或灭菌，并使用计时器控制消毒或灭菌时间。
3.结肠镜清洗应使用流动水。
4.结肠镜清洗消毒的记录应齐全，登记内容应包括就诊患者姓名、住址、电话及使用结肠镜的编号、清洗时间、消毒时间、操作人员姓名及消毒人员样名等事项。
