1952年成立倪邱乡，1958年改为跃进人民公社，1969年成立倪邱人民公社，1983年改设倪邱区，1992年撤区并乡时改设倪邱镇，镇政府驻地倪邱集。
1999年工农业总产值13604万元，乡镇企业收入12494万元，财政收入542万元，农民人均收入2577元。
倪邱，即西汉名儒倪宽墓，其故里倪邱，曾为汉御史大夫。茨河南岸有一谷堆，多次发现有陶俑、石箭等出土，据专家鉴定为殷代遗址，故倪邱又名谷堆集。
该镇薄荷油专业市场远近著名，经常商户云集，产品销往全国各地。1995年被原阜阳行署命名为“薄荷状元镇”。
倪邱镇是省新农村建设示范镇，副县级建制中心镇，“十二五”期间太和县经济次发展中心。
2011年末，倪邱镇辖东门、西门、北门、东顺河、西顺河、张路、张大营、孙庙、大杨、崔寨、叶堂、花园、马厂13个村民委员会。
截至2020年6月，倪邱镇下辖3个社区和10个行政村。镇人民政府驻倪公祠旧址。[2]
西门社区花园村崔寨村北门社区西顺河村东顺河村东门社区叶堂村张大营村张路村孙庙村/马厂村大杨村/位置境域倪邱镇地处太和县中北部，东接坟台镇，南邻马集乡，西连赵庙镇，北依桑营镇。区域面积68.86平方千米。
地形地貌倪邱镇地处淮北平原，地势平坦，西高东低。
气候倪邱镇属暖温带半湿润季风气候。其特点是四季分明，气候温和，雨量适中，无霜期长。年平均气温14.9℃，无霜期年平均214天，年平均降水量797.2毫米。
水文倪邱镇境内河道属淮河流域。境内河流黑茨河，境内长8千米，自西向东贯穿全境。另有宋汤河、北皂沟、冯沟，田河沟、黄沟等。
自然灾害倪邱镇主要自然灾害有干旱、洪水、低温、霜冻。2011年春季，共有5.2万亩小麦遭受旱灾，直接经济损失达480万元。
倪邱镇土地肥沃，物产丰富。农业种植呈粮、经、饲三元结构，粮食作物以小麦、大豆、玉米、高粱、红芋等为主，经济作物以芝麻、油菜、棉花、烟叶、薄荷、中药材等见长，薄荷油年产量占全国总产量比重大，油质特佳。中药材主要品种有桔梗、板兰根、白术、白芍、党参、牡丹、药菊等，均以产量高、质量好而闻名中外。
人口2011年末，倪邱镇辖区总人口5.6万人，其中城镇常住人口18813人，城镇化率33.6%。总人口中，男性26851人，占48.1%；女性29049人，占51.9%；14岁以下8944人，占16%；15~64岁30735人，占54.9%；65岁以上16221人，占29.2%，人口均为汉族。2011年，人口出生率13‰，人口死亡率6‰，人口自然增长率7‰。
2017年末，倪邱镇常住人口53885人。
截至2019年末，倪邱镇户籍人口65024人。
地名由来倪邱镇因西汉武帝时御史大夫倪宽曾在此为官，为政宽厚，死后，百姓葬其衣冠于此得名。
文物古迹倪邱集遗址是安徽省阜阳市太和县唯一保存的历史文化遗址。
据文物部门考证，该遗址属大汶口时期文化，曾发掘有石斧骨针陶器青铜器等大量文物，其中以1952年出土的青铜麒麟灯和1984年发现的唐代瑞兽鵉鸟镜最为著名。遗址上建有倪公祠、经锄楼、课最堂等古代建筑。其中一株明朝的古柏己历经400余年的世事沧桑。
倪邱镇
相传，经锄楼为西汉武帝时期御史大夫倪宽幼年读书的地方。明嘉靖年间，后人为纪念倪宽“勤奋好学，为民宽厚”所建，是太和八景之一，史称“锄楼映月”。倪公祠--始建何年不详，据史料记载是明万历二年知县刘玠重建，清乾隆40年知县宋丁奇又修。知县每年捐白银20两作经锄书院经弗，清同治五年当地人马怀珍重修，清末，经锄书院改名逊师小学。后遭兵乱竹办，藏书己无存。经锄楼--明嘉靖年间建有方形两层小楼，取名经锄楼以纪念倪宽“经锄楼"三个字是清大书法家梁献手笔。课最堂-以纪念倪宽为民宽厚而建。
综述2011年，倪邱镇财政总收入325万元。
2019年，倪邱镇有工业企业16个，其中规模以上10个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市98个。
倪邱镇的资源与特产
农业倪邱镇有农业耕地面积6.6万亩。2011年，农业总产值2.1亿元，比上年增长6.1%，农业增加值占生产总值的43.4%。粮食作物以小麦、玉米为主。2011年，生产粮食4.7万吨。畜牧渔业以饲养生猪、家禽为主。2011年，生猪饲养量3.2万头；家禽饲养量12万羽。
工业倪邱镇工业形成以人发加工业、粮食加工业、木材加工业、非煤矿山企业为主的工业体系。2011年，工业总产值达到2.4亿元，比上年增长7.6%；工业增加值占生产总值的20.5%。2011年，中小企业12家，职工563人，实现工业增加值0.5亿元，比上年增长20.5%。
商业2011年末，倪邱镇有商业网点428个，职工458人。2011年，社会商品销售总额1.5亿元，比上年增长5.3%。
教育事业2011年末，倪邱镇有幼儿园8所，在园幼儿1310人，专任教师29人；小学13所，在校生5060人，专任教师216人；初中1所，在校生1423人，专任教师89人，小学适龄儿童入学率、九年义务教育覆盖率均达100%。
文体事业1988年，倪邱镇开通镇广播电视站。2011年末有广播喇叭360只，覆盖率达到100%；有线电视用户2000户，占城镇居民户数的58%。无线广播覆盖率100%。
2011年末，倪邱镇有综合文化站1个，农家书屋10个，藏书4万册。
2011年末，倪邱镇有体育场地4处，经常参加体育活动的人员占常住人口的31%。
医疗卫生2011年末，倪邱镇有各级各类医疗卫生机构14个；病床110张。专业卫生人员65人，其中执业医师13人，执业助理医师13人，注册护士14人。2011年，医疗机构（门诊部以上）完成诊疗9.8万人次。2011年，新型农村合作医疗参合率97%。
社会保障2011年，倪邱镇有城镇最低生活保障户数52户，人数63人，支出11.2万元，比上年增长18%，月人均148元，比上年增长20%。农村最低生活保障户数1074户，人数2240人，支出104万元，比上年增长15%；农村五保集中供养86人，支出14.6万元，比上年增长16%；农村五保分散供养361人，支出50.5万元，比上年增长16%；农村医疗救助171人次，民政部门资助参加合作医疗1530人次，共支出104万元。国家抚恤、补助各类优抚对象128人。
基础设施邮政电信2011年末，倪邱镇有邮政网点13个，固定电话用户2800户，移动电话用户8800户，宽带接入用户1400户。
给排水2011年末，倪邱镇区有自来水厂1座，深水井1眼及成套净化设备，年供水20万吨，供水户达3000户。
供电2011年末，倪邱镇区有供电所1座，35千伏变电所1座、主变压器164台，总容量10万千伏安，供电1.6万户，高压输电线路总长度107千米，全镇通电率100%。
郭宪，字子横，东汉汝南宋（今安徽省太和县倪邱镇。倪邱镇西汉为新郪县，东汉章帝建初四年（79），改封殷商后裔于此，为宋公国，属汝南郡。《后汉书·方术列传》：郭宪是“汝南宋人也。”东汉属于汝南郡的宋只有今太和县倪邱镇）人。早年拜东海王仲子为师，经仲子推荐，受到王莽的重视。王莽篡汉后，拜郭宪为郎中，差人送去官服，要他去朝里做官。他把官服烧掉，逃到东海隐居。刘秀当了皇帝，拜他为博士。
刘秀西征隗嚣(音weiyin，当时中国西部少数民族首领)，郭宪拦住他的车子说：“天下初定，车驾未可以动。”并拨出佩刀，割断刘秀车上的马绳，刘秀不听他的劝告，军队到了下部，后方发生动乱，刘秀星夜赶回洛阳，叹惜说：“恨不听子横之言！”
北方的匈奴不断向南侵犯，刘秀召集群臣商议对策，郭宪以为“天下疲蔽，不宜动众。”刘秀没有采纳他的意见，他非常恼火，装作头晕倒地，对皇帝拜也不拜，径自下殿而去。刘秀望着他的背影，向群臣说：“尝闻关东献觥（刚直的样子）郭子横，竟不虚也。”宪遂以病辞官，卒于家。
据传著有《洞冥记》60篇，都是记载神仙道术和远方怪异的故事。但不似汉代文章风格，疑是伪托。
郭宪的事迹记载在《后汉书·方术列传》。
倪邱镇境内有105国道过境，境内长14千米；省道高范路境内长10千米；倪赵路乡道长15千米。2011年末，共建成水泥、柏油路长75千米，全镇实现了公路村村通。
