朱瑾是朱瑄的堂弟，在中和三年（883年）朱瑄担任天平军节度使时被补任为军校，随朱瑄镇守郓州（天平镇治所，在今山东东平）。他勇冠三军，有吞噬四方之志，与朱瑄都暗怀争夺天下的雄心。
光启二年（886年），朱瑾在朱瑄的支持下，打算吞并邻镇兖州的泰宁军。他假意向泰宁节度使齐克让求婚，趁机以迎亲的名义带兵进入兖州，而后在迎亲当夜发动突袭，驱逐齐克让，控制了泰宁镇，自称留后，不久被朝廷正式授为泰宁节度使，时年仅二十岁。此后，朱瑄、朱瑾兄弟雄踞山东，不纳贡赋，赏罚由己，朝廷只能姑息。
朱瑾
交恶朱温光启三年（887年），蔡州节度使秦宗权大举进攻宣武镇（治汴州，在今河南开封）。宣武节度使朱温与朱瑄兄弟既是同姓又是同乡，乃遣使向他们求援。朱瑄、朱瑾皆亲自领军驰援汴州，在边孝村之战中与宣武军（汴军）一同大破蔡州军。秦宗权自此实力大损。此战，朱瑾在敌阵之中单骑驰突往返，当者无不披靡。朱温为此非常感激朱瑄、朱瑾。
朱温联合朱瑄、朱瑾击败了秦宗权，但很快便反目成仇。当时，朱瑄、朱瑾非常欣赏汴军的勇悍，便暗中以重利引诱汴军士卒来投。而朱温也忌惮于朱瑾兄弟的勇武，且因郓、兖两镇多出精兵，亦有吞并之意。他让部下军卒诈作贪利而转投郓兖，然后致信朱瑄，指责其招纳汴军叛徒。朱瑄则报以一封措辞严厉的回信。朱温遂以此为借口，出兵攻打朱瑄、朱瑾。
汴军攻入天平镇，先破曹州（治今山东定陶西南），随即又攻濮州（治今山东鄄城北），与郓兖联军会战于刘桥（在今山东菏泽东北）。郓兖联军大败，折损数万人，邹务卿等五十余名将领被擒，朱瑄、朱瑾只身逃回郓州。汴军攻破濮州，乘胜进攻郓州，但最终被朱瑄击败。曹州亦被朱瑄夺回。汴军乃放弃濮州，退回本镇。自此，朱瑄、朱瑾与朱温交恶。
十年混战龙纪元年（889年），朱温在攻灭秦宗权后，将兵力集中到了东部，主要对手便是朱瑄、朱瑾以及割据徐州的感化节度使时溥。朱瑄、朱瑾为了对抗朱温，在汴军攻打徐州时出兵援助时溥，同时又结好于朱温的宿敌河东节度使李克用。李克用亦上疏朝廷，声讨朱温擅攻朱瑄、朱瑾及时溥之罪。
大顺二年（891年），朱瑾率军三万，进攻单父（治今山东单县），却被汴将丁会击败于金乡。此战，泰宁军损兵两万余。宗江等七十余名将领皆被汴军俘虏，朱瑾单骑逃归兖州。
景福元年（892年），朱温命丁会将兖州数千户百姓迁往许州（治今河南许昌），后又命朱克让率众劫掠兖、郓两镇的麦子。是年年末，朱温遣长子朱友裕攻取濮州，随后又命其移兵攻打徐州。时溥固守城池，同时向朱瑄、朱瑾求援。
景福二年（893年），朱瑾亲率郓州、兖州两万兵马援救徐州，与汴军战于城南石佛山。他杀死汴将霍存，连破汴军十余寨，打得朱友裕坚守营寨不敢出战，后因军粮将尽，只得退回兖州。朱温又以大将庞师傅友裕领军，终于攻破徐州。时溥自焚而死，感化镇自此为朱温所有。后来，庞师古又移兵攻兖州，多次战败朱瑾，同时让先锋葛从周引兵攻齐州（时属天平镇，治今山东济南）。朱瑄、朱瑾皆遣军增援齐州。
乾宁元年（894年），朱温亲率大军进攻郓州，屯驻于鱼山（在今山东东阿西南）。朱瑄、朱瑾乃合兵一处，分三路出击，与朱温战于东阿。两军即将交战之际，东南风大起，但随即又转为西北风。朱温命士卒顺风纵火，烟焰漫天，并乘势发动攻击。郓兖联军大败，被杀万余人。不久，葛从周又攻攻攻向新泰，生擒泰宁军将领张约、李胡椒等人。朱瑾兄弟因屡遭败绩，只得向李克用求援。李克用遣骑将安福顺、安福应、安福迁统率五百精骑，借道魏州南下，增援兖郓。
乾宁二年（895年），朱温遣养子朱友恭围攻兖州。朱瑄亲率步骑自郓州赴援，却在高梧（在今山东郓城北）被朱友恭设伏击败，所押运的粮饷被全部抢走。安福顺、安福庆亦被汴军擒获。李克用又遣史俨、李承嗣率万余骑兵南援。朱友恭乃退回汴州。后来，朱温又亲攻兖州。朱瑄乃命部将贺瓌、何怀宝等率万余人驰援朱瑾，却被汴军截击于钜野南。郓州援军大败，包括贺瓌、何怀宝在内的三千余人被俘。朱温收降贺瓌，将其余俘虏悉数斩杀，而后班师回汴。不久，朱温又命葛从周攻兖州。朱瑾固守城池，不敢出战。葛从周于是领兵奔高梧，诈称要去抵挡天平军、河东军援兵，却在半夜潜回兖州城下的营寨。朱瑾果然出城来袭，结果被葛从周杀得大败。兖州军折损千余人，都将孙汉筠也被汴军俘虏。
乾宁三年（896年），李克用再遣史俨、李承嗣统领三千骑兵，南下援救郓兖，随即又向魏博节度使罗弘信借道，命李存信率军三万屯驻莘县，以为后援。河东军在任城大破汴军，解除兖州之围。但李存信在莘县纵兵劫掠，激怒了罗弘信，被罗弘信设伏击败。罗弘信自此与李克用绝交，转而依附于朱温。李承嗣、史俨被断绝归路，无法北归。李克用亦无法继续派遣援军。当时，天平、泰宁两镇因连年兵灾，人口流失严重，百姓无法安心耕织，春秋两季的粮食又屡遭汴军劫掠，府库日趋空竭。朱瑄、朱瑾再也无力对抗朱温。后来，朱温又命庞师古、葛从周合兵攻郓州。
乾宁四年（897年），庞师古终于攻破郓州。朱瑄在出逃途中被葛从周抓获，押赴汴州处死。当时，朱瑾正与李承嗣、史俨等在徐州一带筹措粮食，只留部将康怀英守兖州。葛从周遂趁虚进袭兖州。康怀英乃与朱瑾的儿子及辛绾、阎宝等将领合谋，献城投降汴军。淄青节度使王师范随后亦被迫归附朱温。至此，宣武镇东部的藩镇势力全部被朱温所吞并。
屡次北征光化二年（899年），朱瑾又随杨行密北攻徐州，屯于吕梁（在今江苏徐州东南），后因朱温亲率大军来援，乃引兵撤走，却被汴军追败于下邳（治今江苏睢宁西北）。
天复二年（902年），唐昭宗以李俨为江淮宣谕使，拜杨行密为东面诸道行营都统、封吴王，让他讨伐朱温。杨行密乃建立吴国（南吴），并承制封授官吏，以朱瑾领平卢节度使。不久，朱瑾随杨行密北征，但攻宿州不下，最终以“粮运不继”为由撤回淮南。
天复三年（903年），杨行密又承制加授朱瑾为东面诸道行营副都统、同平章事。
天祐四年（907年），朱温篡唐称帝，建立后梁。当时，杨行密早已去世，其子杨渥继立，但在兵谏中被张颢、徐温所架空。杨渥拒不承认后梁政权，仍沿用唐朝年号，继续与朱温相抗衡。张颢、徐温于次年（908年）又弑杀杨渥，改立其弟杨隆演。徐温随后又杀张颢，掌握吴国军政大权。朱瑾在此期间一直效力于吴国，但在权力更迭中并没有发挥影响。
天祐十年（913年），梁将王景仁入寇淮南。朱瑾与徐温率军抵御王景仁，起初败于赵步（在今安徽凤台东北），随即又整军再战，在霍邱大败梁军。
天祐十一年（914年），武宁节度使蒋殷据徐州反梁，归附吴国。后梁遂命牛存节、刘鄩讨伐蒋殷。朱瑾率军援救徐州，却为梁军所败。后来，徐温以长子徐知训居国都广陵（治今江苏扬州）辅政，自领兵出镇润州（治今江苏镇江，与广陵隔江相望），后又改镇升州（治今江苏南京）。但吴国大政始终都由徐温决断。
天祐十三年（916年），宿卫将李球、马谦劫持杨隆演，以勤王的名义召集库兵讨伐徐知训，陈兵于天兴门外。朱瑾恰自润州入都，率部击溃乱兵，擒斩李球、马谦。后来，朱瑾又与徐知训统兵北征后梁，围攻颍州，以配合盟国晋国（即河东镇）的军事行动，后因梁将袁象先率军来救，乃撤归淮南。
假婚夺兖州朱瑾雄壮勇猛非凡，性情颇为残忍。光启年间，朱瑾与兖州节度使齐克让结亲，朱瑾从郓州装饰华丽的车子衣服，私藏兵器甲士，以赴婚礼宴会。成亲之夜，甲士偷偷出击，俘获了齐克让，朱瑾自封为兖州留后。当蔡州贼寇嚣张时，朱瑾与太祖联手，共同征讨秦宗权，先后屡次获胜，因功正式被授与兖州节度使。在得到士兵拥护后，便有兼并天下的意图，连太祖都顾忌他。朱瑾用厚利招诱太祖的军士，作为间谍。到太祖进攻郓州时，朱瑾出兵援救郓州，多次与太祖交战。
投靠杨行密朱瑾在兖州失陷后，与李承嗣、史俨等率残部北奔沂州（治今山东临沂），却为刺史尹处宾所拒，又转奔海州（治今江苏连云港西南）。但汴军在后穷追不舍。朱瑾只得率部渡过淮河，投靠淮南节度使杨行密。杨行密亲自到高邮迎接，以朱瑾为淮南行军副使，并表举其为武宁节度使。淮南军素习水战而不擅骑射，自得河东、郓、兖等部骑兵，军声大振。
朱温既平郓兖，又欲尽吞江淮，于是兵分两路，入侵淮南。东路庞师古率徐、宿、宋、滑四州之军直趋清口（在今江苏淮阴西），攻扬州；西路葛从周则率兖、郓、曹、濮四州之军进驻安丰（在今安徽寿县西南），攻寿州（治今安徽寿县）。朱温自屯宿州，策应两路大军。淮南震恐。杨行密乃与朱瑾率三万大军北上楚州（治今江苏淮安），向清口推进。
庞师古很快便进抵清口，他不听部将劝阻，将营寨驻扎在低洼之处，同时又恃众轻敌，平时以弈棋为乐，不作军事部署。杨行密于是让朱瑾堵塞淮河上流，准备以淮水冲灌汴军营寨。朱瑾随后又与裨将侯缵率五千骑兵偷渡淮河，打着汴军旗帜，自北向南直攻庞师古的中军大营。汴军仓皇拒战，又遭大水灌营，顿时陷入混乱。杨行密此时又亲率大军渡淮来攻，与朱瑾两面夹击，大破汴军，斩杀以庞师古为首的汴军将士万余人。时为乾宁四年（897年）十一月。
葛从周此时亦被寿州团练使朱延寿击败，退驻濠州（治今安徽凤阳东北），及闻东路军溃退，乃撤军而去。当时，杨行密与朱瑾已乘胜西进，于是和朱延寿一同追击汴军，最终在淠水大破葛从周。汴军被“杀溺殆尽”，残部在撤退途中又有无数士卒冻饿而死，最终撤回汴州的不足千人。朱温闻听两路皆败，亦自宿州退回。自此，杨行密雄霸江淮，朱温亦无力南下相争。而朱瑾则连年北犯，成为朱温的东南之患。
自刎而亡徐知训辅政期间，骄横恣肆，不但凌辱诸将，甚至经常侮弄杨隆演，毫无君臣之礼。他早年曾向朱瑾学习兵法，得其悉心教授，后因向朱瑾索求名马被拒，竟派遣数名刺客去刺杀朱瑾。朱瑾将刺客悉数击杀，掩埋于后院，但却隐忍不发。后来，朱瑾派家妓去问候徐知训，却差点被徐知训强行占有。他愈加愤愤不平，数次劝说杨隆演寻机诛杀徐氏父子以除国患。
天祐十五年（918年），徐知训因忌惮朱瑾在朝中的地位太高，于是在泗州（治今江苏盱眙）设置静淮军，外放朱瑾为节度使。朱瑾更是愤恨，遂决定诛杀徐知训。当时，徐知训在家中设夜宴为朱瑾饯行。朱瑾亦于次日一早去向徐知训辞行，却得知徐知训夜醉未起，遂以“不奈朝饥”为由返回家中。徐知训酒醒后，表示自己会在晚上去拜朱瑾。
徐知训当晚来到朱瑾府中。朱瑾设宴款待徐知训，席间让宠姬频频劝酒，还答应将其此前索要的那匹名马相赠。徐知训甚喜。朱瑾随后又将徐知训请进内室，唤妻子陶氏出来相见。徐知训正与陶氏见礼之时，被朱瑾在背后用笏板砸倒在地。早已埋伏好的兵士随即冲出，将其杀死。徐知训虽带有随从数百人，但皆在室外，对其被杀一事丝毫没有察觉。当时，朱瑾还特意在庭院内拴了两匹烈马，在请徐知训入内室时命人暗中解开马绳，用两马互相踢咬、嘶鸣的声音来掩盖内室发出的躁动声。
朱瑾随即驱散徐知训的随从，骑马驰入王府，将徐知训的首级拿给杨隆演看，道：“我已为吴国除去这个祸害。”杨隆演惊惧之下，掩面避入内室，道：“此事是您一人所为，我什么都不知道。”朱瑾忿然道：“婢子不足以成大事！”他拿起徐知训的首级，狠狠地地向柱子，转身提剑而出。但王府子城使翟虔（徐温的亲信）此时已关闭府门，并领府兵围捕朱瑾。朱瑾跳墙而出，却摔折了脚，自知无法脱身，乃道：“吾为万人去害，而以一身死之！”他说完便自刎而死，时年五十二岁。
徐温的养子徐知诰在润州闻听广陵之变，当日便引兵入广陵平乱，族灭朱瑾满门。徐温因亲子皆幼弱，乃以徐知诰接替徐知训执掌吴国国政，并命其将朱瑾的尸首沉入雷塘。后来，徐温亲自赶至广陵。徐知诰与严可求乃将徐知训的过恶尽皆告知徐温。徐温这才知道徐知训在广陵的胡作非为，怒气稍解，命人将朱瑾的尸首捞出，改葬于雷塘之侧。
割据泰宁时期：朱瑾二十岁时便据有泰宁镇，成为一方节帅，与朱瑄雄踞山东。他出兵援助朱温，在边孝村之战中击溃蔡州军主力，使得朱温最终攻灭秦宗权，稳定了宣武镇的势力。后来，朱瑾、朱瑄兄弟与朱温反目成仇，进行了长达十年的混战，但是胜少败多，最终势力被朱温兼并。但他在一定程度上，拖住了朱温的兵力，缓解了晋国李克用势力在梁晋争霸中的压力。
依附吴国时期：朱瑾在归附淮南后，改善了淮南军“善水战不任骑射”的局面，增强了淮南的骑兵实力，并协助杨行密取得清口之战的胜利，斩杀汴军主帅庞师古，挫败了朱温吞并淮南的图谋，使得杨行密得以雄霸江淮、建立吴国，此后又连年率军北犯，成为朱温的东南之患。他因不满徐温、徐知训父子专权，用计杀死徐知训，希望能重新振兴杨氏，但最终以失败告终。徐知诰正是借着朱瑾杀死徐知训的契机，由润州进入广陵中枢，接掌了徐知训留下的权力空白，为日后取代吴国、建立南唐奠定了基础。
刘昫：瑄、溥不以善取，固宜凶终。瑾持此狼心，安逃虎口？王纲之紊，群盗及兹，复何言哉！
薛居正：夫云雷构屯，龙蛇起陆，势均者交斗，力败者先亡，故瑄、瑾、时溥之流，皆梁之吞噬，斯亦理之常也。惟瑾始以窃发有土，终以窃发亡身，《传》所谓“君以此始，必以此终”者乎！
王夫之：朱瑾曰：一瑾横戈冲犯大敌，今乃知匹夫之勇不及公远矣。”无他，瑾虽勇于杀人，而不能无畏死之心，愤然一往，理不及而莫持其终也。
李慈铭：朱宣朱瑾兄弟，雄长山东，而卒灭于朱温。宋人陈龙川讥其不能约纵诸镇，掎角进取，而仅首尾相救，自取灭亡。然宣瑾尝结时溥李克用而皆不济，且所据为鄂濮曹魔齐沂海七州，地皆滨海。温以全豫之力，南至淮，西界晋，北包赵，东面而制两镇，尚十余兴师而始克宣。瑾以出掠食，其子乃降，卒假吴兵，大破温于清口，斩其大将庞师古，报克两镇之仇，亦可谓英雄矣。（《越缦堂读书记》）
蔡东藩：① 乱世无公理，亦几无天道。朱瑾曾救朱全忠，全忠乃诬罪加兵，夺其地，辱其妻，杀其兄，张夫人虽有微言，得释瑾妻为尼，然一经玷污，毕生难涤，全忠之恶，可胜数乎？?② 如徐知训之不道，朱瑾诛之宜也；但瑾之所为，未免卤莽，投鼠尚且忌器，岂有内为孱主，外有强镇，顾可为孤注之一掷乎？况徐温亦非真懵于事者，特未闻其子之过恶耳。为瑾计，何不致书徐温，直陈知训罪状，令他自行废置，乃诱诛知训，卒致杀身亡家，武夫之一往直前，不知审慎，往往有此大弊。幸徐温入都，心目中尚有吴王，不致篡夺，否则隆演之首，几何而不立陨也。史称温梦瑾挽射，始为改葬，瑾未必有此灵异，但亦因严可求、徐知诰之先陈子恶，未免生悔，悔则因致成梦耳。
杀兄拒降乾宁二年(895)春天，太祖命大将朱友恭进攻朱瑾，挖掘堑壕包围他。朱瑄派将领贺瑰以及蕃族将领何怀宝奔赴支援朱瑾，被朱友恭擒获。十一月，朱瑾的堂兄齐州刺史朱琼献州投降，太祖下令捆着贺瑰、何怀宝以及朱琼在城下示众，对朱瑾说：“你哥哥已败，你要及早效仿投降。”朱瑾假装派牙将瑚儿带着书信、钱币送给太祖请求投降。太祖亲自到延寿门外，与朱瑾交谈。朱瑾对太祖说：“我想让大将送上符印，希望让堂兄朱琼来领取。”太祖派朱琼与客将刘捍前往领取印信匣子，朱瑾单马立于桥上，挥手对刘捍说“：可让我堂兄前来，我有私话相告。”太祖即令朱琼前往。朱瑾先让骑士董怀进埋伏在桥下，当朱琼一到，董怀进突然奔出，抓获朱琼回城，接着朱瑾砍下朱琼脑袋丢到城外，太祖才绝望回师。
针锋相对朱瑾据有泰宁时，曾招募骁勇数百人组建一支部队，在他们的双颊上刺了两只雁子，号称“雁子都”。朱温为了对抗朱瑾，也组建一支部队，号称“落雁都”。
吴军双绝朱瑾善用马槊，在吴军中与善射的米志诚并称骁将，号为第一。但安仁义素来自负箭术，对朱瑾、米志诚多有不服，常道：“米志诚的十张弓，比不上朱瑾的一把槊；但朱瑾的十把槊，也比不上我安仁义的一张弓。”
兄长：朱瑄，唐末据郓州为天平节度使，后被朱温所攻杀。
妻子：姓氏不详，兖州城破后为朱温所纳，后在张夫人的进言下，被送入庵中为尼。
继妻：陶氏，陶雅之女，朱瑾在淮南期间所娶，朱瑾自杀后亦被处死。
儿子：朱用贞，朱瑄败死后，趁朱瑾在外寻粮，在兖州投降朱温。
《旧唐书·卷一百八十二·列传第一百三十二》
《新唐书·卷一百八十八·列传第一百一十三》
《旧五代史·卷十三·梁书列传三》
《新五代史·卷四十二·杂传第三十》
《十国春秋·卷八·吴八》
《九国志·卷二》
