王基，1565年(嘉靖四十四年)进士，先任户部主事，管理通州马房。他不屈服于有权势的太监，对太仓的收支立抽验法，杜绝了“干没克减”的弊端。
后历任大同府知府、山西副使、右参政、湖广按察使、浙江布政使等职。在任山西参政分守河东道时，他督修河堤，防止了黄河泛溢。1588年(万历十六年)，他以副都御史巡抚大同，有一个被他荐举的镇将来谢他，他托辞不见，说：“我是为国家荐举人才，不是对他施加恩惠，为什么要谢我。”镇守大同的明贵族代王，派人深夜抱着一个坛子来，说是“敬献良酝”，原来是一坛子珍珠。王基拒不接受，斥退来人。后又历任兵部侍郎、南京刑部侍郎、户部尚书兼兵、工二尚书。当上书要求致仕时，明神宗朱翊钧让他推荐最有才能的一个儿子出来做官，他回答说：“我的儿子如有才能，何必由我推荐。如果没有才能，我推荐了，恰好给我添累赘。我不能用我这把老骨头来为子孙换官做”。致仕回家3年后病逝，赠太子少保。
著有《云中奏议》若干卷。
