藻体鲜绿色或黄绿色，外被钙质。高18～301厘米，茎具3列式皮层，节间小于小枝，无皮层；托叶双轮，不发达，小枝7～8枚一轮，由8～11个节片组成，除末端1～2个节片外，均具皮层。
繁殖器官配子囊生于小枝下部3～4个节上，藏卵器长不过1毫米。
营养体轮藻属
轮藻门植物的所谓根、茎、叶，实际上是由地下部分无色的假根和地上部分的中轴、侧枝和小枝几部分组成。中轴（茎）明显地分节和节间两部分，每个节上生有一轮小枝（叶）及侧枝。不同属小枝构造各异，轮藻属不分枝，丽藻属具一至多次分叉。侧枝具有顶端继续生长的能力生殖器官轮藻的生殖系统
轮藻门的有性生殖器官发达，雌性生殖器官称为藏卵器。它们均生在小枝上，雌雄同株或异株，藏卵器呈长圆形，外面由5列细胞包被，最下部的5个细胞长形，螺旋形围绕，位于藏卵器顶端的细胞很短。形成由5或10个细胞排列成一轮或二轮的冠（通称冠细胞）。藏精器呈球形，外壁由8个（罕见4个）盾片状的细胞组成。盾片细胞内侧中央有盾柄细胞，其上产生排列成丝状的单细胞精囊丝，每个细胞产生一个具2条鞭毛的精子。轮藻门除有性生殖外，有的种类地下假根部分的节上可产生珠芽，以进行营养繁殖。色素贮存物质轮藻门的色素和贮存物质与绿藻门相似（因此，有的藻类学家将轮藻列入绿藻门，作为轮藻纲），但轮藻类的营养体及生殖方式比较复杂，同绿藻门区别较大。
轮藻属
主要生长在淡水、半咸水中尤以稻田、沼泽、湖泊中常见，在一些透明度高的瘦水池塘中也经常发生，特别是那些经常用生石灰清塘而富含钙质的硬水中，更容易大量繁殖。大多在低地生长，但在4000m以上的高山湖泊中也能生存。多数种类是广温性的，即能在冷水中生长、也能在高温的温泉中生存；少数种是狭温性的，如丽藻属的多数种只能在冬季水温较低的水域中生存。
主要分布于世界范围内除了南极洲外的各大洲都有，温带最多。
轮藻除光合产氧对改善水质有一定作用外，很难被鱼类取食和利用，没有更多的渔业价值。轮藻一般作为植物生理学或细胞学的实验材料，也有的作饲料、肥料、药用。有的还发现轮藻能杀蚊子幼虫和净化污水。
轮藻仅有营养繁殖和有性生殖，不产生无性孢子进行无性繁殖。
1、营养繁殖
轮藻植物最普遍的营养繁殖方式是以植物体断裂方式来进行的，其断裂的茎段的节上能长出假根和芽，从而发育成新植物体。此外，在假根的节上会产生单细胞或多细胞组成的珠芽，多呈球形，内含丰富淀粉，类似于被子植物的块根或块茎，以此繁殖新的藻体。2、有性生殖
轮藻有性生殖方式为卵式生殖。卵囊成熟后，卵囊的冠细胞下方裂开形成5条缝。而成熟精子囊的8个盾细胞则互相分开，其精囊丝被暴露出来。环境适宜时，精子从精囊丝上释放出后通过卵囊上的裂缝进入内部与卯结合，形成厚罐合子。经数周或数月休眠后萌发，萌发前经减数分裂，形成4个单倍体子核，其中3个分解消失，1个核连同原生质体继续发育成为一条绿色的有节和节问分化的丝状结构，称为原丝体，再由原丝体进一步生长分化出新的植株。生活史类利为合子减数分裂，仅具一种植物体，具核相交替。
轮藻属
轮藻细胞分裂图
细胞内具有小形盘状或椭圆形色素体；光合色素为叶绿素a和b,以及β胡萝卜素、叶黄素和其他类胡萝卜素；无蛋白核；同化产物为淀粉。单核。在成熟的细胞中具大的中央空泡。只有卵配生殖,生殖器官发达，具藏精器和藏卵器，生于小枝的节上或小枝轮基部，成熟时多呈橘红色或金褐色，精细胞具有2条等长，顶生偏于一侧的鞭毛。有些种类能在地下假根部分的节上产生珠芽，进行营养繁殖。分1纲、3目（直立轮藻目、右旋轮藻目、左旋轮藻目）,现存仅左旋轮藻目的轮藻科，含6属，约400种，中国已报道的有150多种。广泛分布于各种淡水或半咸水中，稻田、池塘、湖泊、沼泽中尤为常见。现存轮藻科的分类采用J.格罗夫斯(1935)和R.D.伍德(1962)系统。它们代表了当前对轮藻演化趋势的两种看法。20世纪70年代以前，以格罗夫斯为代表认为轮藻的器官形态演化趋向是：小枝从等势分叉经单轴式分叉到不分叉；茎和小枝由不具皮层经具不完全的皮层到具完全皮层；藏精器由位于藏卵器的上方经二者并列到位于藏卵器的下方；藏卵器的冠细胞由双层到单层。根据这一设想丽藻属是现代轮藻中最原始的属，经过鸟巢藻属这一中间类型，演化为最高级的轮藻属，其他各属则是这一进化干上的旁支。以后，R.D.伍德等人(1965)又提出了与此相反看法。我国常见的有轮藻属（Chara），丽藻属（Nitella）和鸟巢藻属（Tolypella）。轮藻属
轮藻门轮藻科最常见的一属。植物体上往往有钙质沉积。茎或小枝多具皮层；小枝不分叉，但节上生有苞片细胞；茎节上具有1～2轮托叶。雌雄同株、雌雄配子囊混生者，藏精器生于藏卵器的下方。广布于世界各地，但主要产于北温带，共约180种。中国已知有27种，其中9种为特有种。多生于钙质丰富、有机质较少、呈微碱性的淡水或半咸水中，特别是在透明度大，少浮叶植物生长的浅水湖、池塘、沼泽中，常大量生长。丽藻属（Nitella），轮藻门轮藻科种类最多、分布较广的一属。植物体柔软、纤细，小枝多等势分叉，少单轴分叉；每个茎节上多为单轮，少2～3轮；常有能育和不育小枝之分，能育小枝多较短、密集，有的尚被有胶质。藏精器多顶生，藏卵器多侧生于小枝的分叉上，有的也生于小枝的基部，藏卵器顶端的冠细胞10枚，排成双层；受精卵纵扁；其外膜常具有各种纹饰。该属约200种，主要产于热带和亚热带地区的微酸性水中。中国已知有90种，其中42种为特有种。
鸟巢藻属（Tolypella）
轮藻门、轮藻科的1属。植物体的小枝均为单轴分叉；每个茎节上的小枝均为单轮；藏卵器和藏精器并生于小枝分叉处的内侧和小枝轮的基部；受精卵椭圆形，外膜平滑或具粒状突起。
(1)农艺措施主要有：一是建立地平沟畅、保水性好、灌溉自如的水稻生产环境；二是结合种子处理清除杂草的种子，并结合耕翻、整地，消灭土表的杂草种子；三是实行定期的水旱轮作，减少杂草的发生；四是提高播种的质量，一播全苗，以苗压草。
(2)化学除草，多数地方采用一次性封杀，就是在播种（催芽）后1－3天内，亩用40%“直播青”可湿性粉剂60克，兑水40－50公斤，均匀喷雾，施药时田板保持湿润。3天后恢复正常灌水和田间管理。通过化除后，如果后期仍有一定量的杂草，可采取针对法进行补除。
如以稗草、千金子为主的田块，在杂草3－5叶期，可用10%千金乳剂50毫升加水30公斤，用针对法进行茎叶喷雾。用药前一天田间必须放干水，药后2天再恢复正常管理。
如以莎草、阔叶杂草为主的田块，在播后30天左右，亩用10%水星可湿性粉剂20克加20%二甲四氯水剂150毫升混用，兑水30公斤针对法喷雾。水浆管理同上。
如田间各种杂草共生，可用48%苯达松水剂75－100毫升加20%二甲四氯水剂150毫升混用，采用针对法喷雾。
